Auto-immuunziekten worden veroorzaakt door een ongewenste reactiviteit van het adaptieve immuunsysteem tegen zelf-antigenen. Hoewel een complex samenspel van genetische en omgevingsfactoren gezien kan worden als de directe oorzaak van de aandoeningen, zijn het afwijkende immuun- en inflammatoire responsen die verantwoordelijk zijn voor de start, progressie en chroniciteit ervan. Auto-reactieve T-cellen en auto-antilichaamproducerende B-cellen vormen de drivers in het lichaam. Daarnaast worden aangeboren effectorcellen, waaronder naturalkillercellen, aangetroffen in ontstoken weefsel en reguleren daar mogelijk immuundisfunctie en inflammatie.
